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李爱贤等
, 2011,
分子生物学
技术在甘薯
(
Ipomoea batatas
(L.) Lam.)
遗传育种中的应用
,
分子植物育种
(online) Vol.9 No.106 pp.1766-1775 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0106)
1770
带来困扰。
Arthur
Labonte (1995)
对美国
8
个州的
甘薯品种“
Jewel
”的无性系进行
RAPD
分析,发
现有
5
个无性系的多态性在
7.1%~35.7%
之间,表
明利用
RAPD
标记可以快速地检测出无性系变异。
随后,
Arthur
Labonte (1996)
又以不同甘薯品种为
材料,用
RAPD
技术对无性繁殖过程中不同来源的
芽变进行进一步分析,表明用分生组织进行无性繁
殖比用不定芽更能保持基因型的一致性。
RAPD
标记技术最早用于作物品种鉴定,
Prakash
(1996)
30
个美国品种进行
RAPD
分析,
发现所有品种都具有唯一的指纹图谱,可有效地进
行品种鉴定。随着对甘薯基因组研究的深入,以及
分子生物学的发展,
AFLP
等分子标记技术在甘薯
中的应用越来越广泛,鉴定体系也越来越完善,使
品种的鉴定工作趋向自动化。
1.7
分子标记技术在甘薯其他方面的应用
近年来,随着分子标记技术的迅速发展,其在甘
薯中的应用范围越来越广。例如,离体保存技术在甘
薯种质资源保存中有着不可替代的优势,用
SSR
记检测国家甘薯试管苗库中离体保存
5
年和
8
年的
24
份种质资源及其对应的田间圃材料的遗传稳定
性,发现这些材料在两种保存方式下谱带一致,说明
两种保存方式的效果相同,该研究为甘薯种质资源长
期离体保存提供了理论依据
(
赵冬兰等
, 2011)
2
甘薯基因的分离与克隆
随着甘薯营养价值的再认识,以及甘薯在转基
因研究中作为生物反应器的重要作用,近年来,各
国逐渐加大了甘薯分子生物学研究的力度。现已分
离到多种特异基因,它们主要与甘薯的品质、块根
发育以及抗逆性有关。
2.1
甘薯品质相关基因的分离与克隆
目前,已经从甘薯中分离了很多品质相关基
因,如影响甘薯块根品质的主要影响因子多酚氧化
(PPO)
、淀粉酶、
ADPG
焦磷酸化酶、胡萝卜素、
花青素等的基因。
PPO
是引起甘薯块根褐变的主要原因,目前已
经从甘薯中分离了多个
PPO
基因。使用兼并性引
物,彭世清和陈守才
(2002)
利用
cDNA
末端快速克
(rapid-amplification of cDNA ends, RACE)
技术,
从甘薯中克隆出全长
1 984 bp
PPO
基因,该基因
包含了完整的开放阅读框,能够编码
588
个氨基酸。
β
-淀粉酶是甘薯块根中最主要的蛋白质,对甘
薯营养品质和口感起决定性作用。张勇为和张义正
(2004)
利用
RT-PCR
技术从甘薯新大紫块根总
RNA
中克隆了
β
-淀粉酶
cDNA
,该
cDNA
不仅能在大肠
杆菌表达,而且能将有活性的
β
-淀粉酶分泌到胞
外;并且,他比较发现,大肠杆菌表达的
β
-淀粉酶
与甘薯块根的
β
-淀粉酶除迁移率不同外,对淀粉酶
活性抑制剂
EDTA
β
-巯基乙醇的敏感性均相同。
ADPG
焦磷酸化酶是淀粉生物合成的
4
种关键
酶之一,
Harn
(2000)
研究发现在甘薯中存在多拷
贝的
ADPG
焦磷酸化酶基因,进一步研究表明其
cDNA
受蔗糖的正调控表达。
β
-胡萝卜素是维生素
A
原,对人体健康具有重
要作用,可降低多种癌症特别是肺癌的发病率。陈
选阳等
(2005)
RACE
技术,分离得到控制甘薯
β
-
胡萝卜素合成的关键酶基因,并通过斑点杂交表明,
甘薯
β
-胡萝卜素生物合成过程中,各种酶在块根发
育的前期具有较强的表达。王飞
(2007)
根据双子叶
植物类胡萝卜素合成结构基因氨基酸保守区域设
计简并引物,扩增出甘薯编码类胡萝卜素合成关键
酶基因的中间片断,并成功地克隆了它的全长,序
列分析表明,该基因与其他植物的序列高度同源。
花青素作为一种天然植物色素,近年来倍受国
外市场关注,紫心甘薯中富含花青素。二氢黄酮醇
-
4
-还原酶
(DRF)
是花青素生物合成途径的
4
个关键
酶之一,在基因库
(GenBank)
中,有
3
DRF
基因
是从甘薯中分离的。
Tanaka
(2004)
首先从甘薯中
分离出了
DRF-B
基因,指出甘薯中至少存在
4
DRF-B
基因的等位基因,并对该基因进行结构分
析,发现其外显子和侧翼区与葡萄的
DRF-B
基因
具有高度的同源性。
2.2
甘薯块根发育相关基因的分离与克隆
甘薯收获的主要器官是块根,块根的发育好坏
直接影响甘薯的产量,与甘薯块根发育相关基因的
分离与克隆受到研究者的广泛关注。
Lee
(2000)
从甘薯块根的
cDNA
文库中筛选了
2
个与块根发育
相关的基因
(iAGPLI)
,序列长度分别为
1 661 bp
1 277 bp
,该基因只在块茎和块根中才能转录表达。
随后,
Kim
(2002)
从甘薯处于着色和块根形成期
的根部也分离出
2
个基因
(
ibMADS3
ibMADS4
)
与甘薯中其他的
MADS
家族基因序列相似性很高,
表达模式及功能相似;这
2
个基因主要在甘薯根部
表达,尤其是在纤维根、着色根和膨大块根中大量
表达;进一步研究表明这
2
个基因在块根形成时进