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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1383
-
1389
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1383
-
1389
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1388
Promega
公司,
PCR-selectTM cDNA subtraction kit
以及
AdvantageTM cDNA Polymerase Mix
购于
Clontech
公司,
pMD
-
19T
载体购于
TAKARA
公司。
试验菌丝培养所用基本培养液为
MMN (Melin-
Norkrans Medium)
培养液,去除其中的麦芽提取物,所
用氮源为
(NH
4
)
2
HPO
4
,终浓度
3.8 mmol/L
,转速
150
r/min
摇床内连续暗培养
15 d
,温度为
(25
±
1)
℃。
3.2
方法
3.2.1
试验材料处理
菌株培养
15 d
后,过滤收集菌丝,重悬于新鲜
MMN
培养液中振荡培养
24 h
,再次过滤,一半重悬
于新鲜
MMN
培养液中振荡培养,作为对照组;一
半重悬于以
100 µmol/L Ca(NO
3
)
2
为唯一氮源的
MMN
培养液中,进行硝态氮诱导,作为处理组,分
别振荡培养
4 h
8 h
24 h
36 h
取材,液氮速存。
3.2.2
RNA
的提取及
mRNA
的纯化
菌丝总
RNA
利用鼎国公司的
PlantRNAzol
剂盒提取,步骤同试剂盒说明书。用
1%
琼脂糖凝胶
电泳,检测
RNA
提取质量,并用微量紫外分光光度
计测定其纯度和浓度;采用
Promega
公司的
PolyA
Tract Systems
(Z5300)
分离
mRNA
,并利用琼脂
糖凝胶电泳检测其完整性。
3.2.3
抑制性差减杂交
采用
Clontech
公司的
PCR-selectTM cDNA Sub-
traction Kit
试剂盒
,
并按其说明书进行。
3.2.4
差减
cDNN
文库的构建及序列分析
第二轮
PCR
扩增结束后,将产物与载体
pMD-
19T
连接,再转化大肠杆菌感受态细胞
DH5a
,完成
cDNA
文库构建。随机选择
300
个阳性克隆进行测
序,去除测序序列中的载体序列和接头序列后,即得
EST
序列,于
NCBI
上进行
Blast
同源比对及功能注
释后,将所得
ESTs
进行基因功能分类。
作者贡献
张春英、孙秋玲是本研究的实验设计和实验研究的执行
人,张春英是项目的构思者和负责人,指导实验设计,数据
分析,论文写作与修改;戴思兰指导论文的写作与修改。全
体作者都阅读并同意最终的文本。
致谢
本研究由国家自然科学基金项目
(30972409)
资助。作者
感谢上海市园林科学研究所尹丽娟、魏翔莺、黄芳以及师姐
陈真在本实验过程中的帮助。感谢两位匿名的同行评审人的
评审建议和修改建议。
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