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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1549
-
1552
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1549
-
1552
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1549
研究报告
Research Report
黄麻幼苗
cDNA
文库的构建和质量鉴定
谢小芳
,
陈燕萍
,
吴为人
福建农林大学生命科学学院
,
福州
, 350002
通讯作者
:
wrwu2005@yahoo.com.cn
作者
分子植物育种
, 2012
,
10
,
75
doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0075
收稿日期:
2012
09
10
接受日期:
2012
09
14
发表日期:
2012
12
22
本文首次发表在《分子植物育种》
(2012
年第
10
卷第
6
747-750
)
上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用
Creative Commons Attribution
License
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,
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引用格式
(
中文
)
谢小芳等
, 2012,
黄麻幼苗
cDNA
文库的构建和质量鉴定
,
分子植物育种
(online) Vol.10 No.75 pp.1549-1552 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0075)
引用格式
(
英文
)
Xie et al., 2012, Construction and Evaluation of cDNA Library from Jute Seedlings, Fenzi Zhiwu Yuzhong (online) (Molecular Plant Breeding) Vol.10
No.75 pp. 1549-1552 (doi: 10.5376/mpb.cn.2012.10.0075)
黄麻全长
cDNA
文库的构建对开展黄麻遗传和功能研究具有重要的应用价值。以生产上的优良品种闽引一号为材
料,利用
Creator SMART cDNA Construction Kit
技术,成功构建了黄麻苗期的全长
cDNA
文库。文库的滴度为
1.9
×
10
6
pfu/mL
随机挑取
86
个克隆进行菌落
PCR
鉴定,结果显示:插入片段的大小在
0.5~2.0 kb
之间。研究结果表明,黄麻全长
cDNA
库的质量较高。
关键词
黄麻
; SMART
技术
; cDNA
文库
Construction and Evaluation of cDNA Library from Jute Seedlings
Xie Xiaofang , Chen Yanping , Wu Weiren
College of life sciences, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, 350002, P.R. China
Corresponding author, wrwu2005@yahoo.com.cn;
Authors
Abstract
Construction of the full-length cDNA library of jute is significant value in genetic and function research. With a well
known jute (
Corchorus capsularis
L.) cultivar Minyin no.1 as material, a full-length cDNA library was constructed using Creator
SMART cDNA Construction Kit technology. This library had a capacity of 1.9×10
6
pfu/mL and the insert sizes was about 0.5~2.0 kb
based on PCR analysis of 86 randomly chosen clones. The results suggest that the cDNA library of jute should have been constructed
successfully.
Keywords
Jute (
Corchorus capsularis
L.); cDNA library; SMART tehonology
研究背景
cDNA
文库是指包含某种生物的某一特定发育
时期内所转录的全部
mRNA
信息的
cDNA
克隆集
合。
cDNA
文库在植物的遗传和功能研究中具有重
要的应用价值,可以用于筛选构建分子连锁图谱的
探针,分离重要基因,分析基因表达信息等,是新
基因发现和功能基因组学研究的基础
(
蔡宁波等
,
2007)
。对于近期不能开展全基因测序的物种而言,
全长
cDNA
文库更是寻找和筛选目标基因的重要手
段之一。在已经克隆的众多基因中,有许多都是通
过筛选
cDNA
文库获得的
(
晏慧君等
, 2006;
王晨等
,
2010)
。近年来,众多学者已经构建了许多模式生物
和重要农作物的
cDNA
文库,通过大规模的
EST
测序,获得了海量的数据,促进了相关植物功能基
因组学研究的发展
(Kikuchi et al., 2003; Kim et al.,
2006; Seki et al., 1998; Carninci et al., 2003)
黄麻是椴树科黄麻属中的一种草本植物,是一
种极其重要的纤维作物,在麻纺和造纸工业中被广
泛应用。黄麻在我国的栽培历史悠久,产量丰富,
21
世纪极具开发潜力的作物之一
(
彭文芳
, 2007)
目前,黄麻的遗传研究主要集中在分类进化、种质
资源,质量性状和数量性状等传统生物学角度上,
从分子水平上来研究黄麻的报道并不多见。总体而
言,黄麻的遗传研究基础相当薄弱,迄今为止,黄
麻尚未见完整的分子遗传图谱,短期内也未能开展
全基因组测序工作。
本研究首次构建了黄麻全长
cDNA
文库,该文库
将为进一步开展黄麻
EST
大规模测序、功能基因组