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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1505
-
1510
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1505
-
1510
http://mpb.5th.sophiapublisher.com
1509
反应体系:
10×LA PCR Buffer
(Mg
2+
plus) 2.5 μL
模板
1.5 μL
dNTP Mixture (10 mmol/L) 1.5 μL
P1
P2
引物各
1 μL
LA
Taq
(5 U/μL) 0.5 μL
ddH
2
O
12 μL
;所用反应程序为:
94
5 min
94
30 s
53
40 s
72
1 min
35
次循环,最后
72
10 min
产物
4
℃保存。回收
PCR
产物,连接载体并转化
感受态细胞,通过蓝白斑筛选及
PCR
阳性克隆鉴
定后测序。
1
WRKY4
克隆引物序列
Table 1 Primer sequences for
WRKY4
cloning
引物
引物序列
(5'
-
3')
Primer
Primer sequences (5'
-
3')
P1
GAGTCCTAAGGGTTCACG
P2
CATACTTCCGCCATCTGT
3'GSP1
GCTTGTGCCTTATGTTGAGCCTGTGG
3'GSP2
TCTCAGGTGACGGATACAGATGGCGG
3'OUT Primer
TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT
3'Inner Primer
CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCAC-
TATAGG
5'GSP1
TCACCTGAGATTCCCACATCACCTGC
5'GSP2
CCACAGGCTCAACATAAGGCACAAG
5'OUT Primer
CATGGCTACATGCTGACAGCCTA
5'Inner Primer
CGCGGATCCACAGCCTACTGATGATC-
AGTCGATG
F1
AGGAAGAAGAAATGGAAGAT
R1
GAAAAACAAAAGGAAGTAGC
3.4
WRKY4
基因
3'
末端的克隆
根据中间片段的测序结果,用
Primer 5
软件设
计特异性引物
3'GSP1 (
1)
,为了提高产物特异性,
3'GSP1
下游设计一个巢氏引物
3'GSP2 (
1)
。通
用引物为
3'OUT Primer (
1)
3'Inner Primer (
1)
参考
TAKARA
公司
3'RACE
试剂盒操作流程,
进行第一轮
PCR
20 μL
反应体系:
ddH
2
O 5.25 μL
1×Cdna Dilution Buffer
8 μL, 10×LA PCR Buffer
(Mg
2+
plus) 2.5 μL, 3'GSP1 (10 μm/L) 1 μL, 3'OUT
Primer 1 μL, 3'cDNA 2 μL
LA
Taq
(5 U/μL) 0.25 μL
PCR
反应程序中退火温度为
65
℃,其他条件与克隆
中间片段所用程序相同。
选取第一轮
PCR
产物
2 μL
为模板,进行巢氏
PCR
dH
2
O 4.25 μL, dNTP Mixture (2.5 mmol/L each)
9 μL
10×LA PCR Buffer
(Mg
2+
plus) 2.5 μL
3'GSP-
2(10 μm/L) 1 μL
3'Inner Primer 1 μL
LA
Taq
(5 U/μL)
0.25 μL
。反应条件与第一轮
PCR
相同。
巢氏
PCR
扩增产物经回收、克隆以及鉴定后,
进行测序。
3.5
WRKY4
基因
5'
末端的克隆
根据中间片段的测序结果,用
Primer 5
软件设
计特异性引物
5'GSP1 (
1)
,为提高产物特异性,
5'GSP1
上游设计一个巢氏引物
5'GSP2 (
1)
。通
用引物为
5'OUT Primer (
1)
5'Inner Primer (
1)
实验操作过程参考
TaKaRa
公司
5'
-
Full RACE
试剂
盒说明进行。
第一轮
PCR
20 μL
的反应体系:
1
×
cDNA Di-
lution Buffer
8 μL
dH
2
O 5.25 μL
5'OUT Primer
(10 μm/L) 1 μL
5'GSP1 (10 μm/L) 1 μL
5'cDNA2 μL
10×LA PCR Buffer
(Mg
2+
plus) 2.5 μL
LA
Taq
(5 U/μL) 0.25 μL
PCR
反应程序中退火温度为
60
℃,
其他条件与克隆中间片段所用程序相同。
取第一轮
PCR
产物
2 μL
为模板,进行第二轮
PCR
dH
2
O 4.25 μL, dNTP Mixture(2.5 mmol/L each)
9 μL, 10×LA PCR Buffer
(Mg
2+
plus) 2.5 μL, 5'GSP2
(10 μm/L) 1 μL, 5'Inner Primer 1 μL, LA
Taq
(5 U/μL)
0.25 μL
PCR
反应中退火温度为
52
℃,其他条件与
第一轮相同。将第二轮
PCR
产物经回收、克隆、鉴
定后测序。
3.6
WRKY4
基因全长的克隆
根据拼接得到的
WRKY4
全长序列设计特异性
引物
F1
R1 (
1)
,以总
RNA
反转录得到的
cDNA
为模板进行
RT-PCR
,反应程序与克隆中间片段的
PCR
程序相同,退火温度为
50
℃。将
PCR
产物回收、
克隆、鉴定后测序。
作者贡献
徐岭贤是本研究的实验设计和实验研究的执行人;徐岭
贤及赵福宽完成数据分析;郝芮及孙清鹏参与实验设计,试
验结果分析;赵福宽是项目的构思者和负责人,指导实验设
计,数据分析,论文写作与修改;全体作者都阅读并同意最
终的文本。
致谢
本研究由北京市属高等学校人才强教计划资助项目
(PHR200907136)
资助。
参考文献
Dong J., Chen C., and Chen Z., 2003, Expression profiles of