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分子植物育种
(
网络版
), 2012
,
10
,
1214
-
1217
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2012, Vol.10, 1214
-
1217
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1216
1
不同方法提取总
RNA
纯度检测
Table 1 Yield and purity of RNA isolated from different organ in populus with different methods
提取方法
植物器官
OD
260
/OD
280
OD
260
/OD
230
浓度
(ng/µL)
Method
Organ
Concentration (ng/µL)
天根
RNAplant plus Reagent
叶片
1.67
1.42
139.7
试剂盒
Leaf
RNAplant plus Reagent
天泽柱式植物
RNAout
叶片
2.08
2.03
211.3
Column RNAout
Leaf
改良
SDS
叶片
2.01
2.04
403.5
Modified SDS method
Leaf
天根
RNAplant plus Reagent
1.26
1.18
263.4
试剂盒
Root
RNAplant plus Reagent
天泽柱式植物
RNAout
1.83
2.24
311.6
Column RNAout
Root
改良
SDS
1.91
1.83
372.5
Modified SDS method
Root
因此含有多糖的
RNA
无法用于分子生物学研究
(Fang et al., 1992)
。本研究中进行了部分改良,采用
LiCl
沉淀剂选择性沉淀
RNA
来减少多糖;另外,
选择短时间沉淀
(
3 min)
以减少非
RNA
沉淀。但
是,
RNA
样品中仍然存在基因组
DNA
,需进行无
RNase
DNase
处理,再进行其他试验。
本试验经琼脂糖凝胶电泳和
RT-PCR
检测分
析,证明了改良
SDS
法完全适用于盐胁迫下杨树总
RNA
提取,为后续分子生物学研究奠定了基础。
3
材料与方法
3.1
材料
1
年生
107
杨截成长约
15 cm
的茎段,置于
盛有蒸馏水的塑料容器中,不定期更换蒸馏水,以
防茎段分泌出的粘液影响生根。待根长至
5 cm
右时,将茎段转移至含有
0.6% NaCl
Hoagland
营养液中胁迫
6 h
,用去离子水冲洗根部,然后用
滤纸吸干根表面水分,迅速剪取叶片和根,用液氮
速冻后置于-
80
℃冰箱保存。
柱式植物
RNAout
购自天泽公司,
RNAplant
plus Reagent
试剂盒购自天根公司,改良
SDS
法药
品均为自己配制,反转录试剂盒购自
Promega
公司,
引物由北京鼎国公司合成。所需试剂
(
除含
Tris
试剂
)
0.1% DEPC
37
℃烘箱处理
24 h
后进行高压
灭菌。所需的研钵等玻璃制品于
180
℃干热处理
12 h
以避免
RNA
酶污染。无
DNase
RNase
移液器枪
头和
Eppendrof
管购自
Axygen
公司。
改良
SDS
提取液:
100 mmol/L Tris-HCl
500 mmol/L NaCl
50 mmol/L EDTA
2.0% SDS
100 mmol/L DTT
5% 2
-
β
巯基乙醇,
pH=7.5 (
其中
巯基乙醇在使用前加入提取液中至终浓度
5%)
3.2
RNA
提取方法
3.2.1
柱式植物
RNAout
方法
100 mg
的叶片和根,经液氮研磨后,按试
剂盒操作步骤说明进行
RNA
提取。
3.2.2 RNAplant plus Reagent
试剂盒方法
称取
100 mg
的叶片和根,经液氮研磨后,按
试剂盒操作步骤说明的方法提取。
3.2.3
改良
SDS
100 mg
叶片和根置液氮冷冻研磨成粉,迅
速置入盛有
350 µL
水饱和酚、
350 µL
氯仿和
700 µL
SDS
提取液的
Eppendorf
管中,涡旋震荡
5 min
4
12 000 r/min
离心
10 min
;上清转入盛有
700 µL
氯仿的新
Eppendorf
管,震荡混匀,于
4
12 000 r/min
离心
10 min
;上清转入盛有
1/4
体积的
8 mol/L LiCl
溶液,常温沉淀
5 min
4
12 000 r/min
离心
10 min
;弃上清,用
75%
乙醇洗沉淀
2
次,最
后短暂离心吸出多余液体,置于真空浓缩仪干燥,
加入
DEPC
处理过的
H
2
O
中溶解
RNA
,于-
80
℃保
存,备用。