Page 20 - 2011no108

Basic HTML Version

李峰等
, 2011,
植物
NBS-LRR
类抗病基因的研究进展
,
分子植物育种
(online) Vol.9 No.108 pp.1784-1790 (doi: 10.5376/mpb. cn.2011.09.0108)
1785
子生物学与分子技术的不断进步,研究者已从众多
的植物中克隆得到了抗病基因,如番茄的
Pto
基因
(Martin et al., 1993)
,烟草的
N
基因
(Whitham et al.,
1994)
以及小麦
Lr10
基因
(Feuillet et al., 1997)
至今,分离与克隆抗病基因的方法已有多种,
如转座子标签法、图位克隆法、表型基因克隆法、
mRNA
差异显示技术等等。通过这些方法,克隆获
得约
50
多个植物的抗性
(resistance, R)
基因,其中,
NBS-LRR
类是最大的一类,
NBS
存在于真核生物
的许多蛋白中,
NBS
区域主要负责
ATP
的水解以
及释放信号。
LRR
是长度在
24
个氨基酸之内的多
重重复,它是蛋白质相互作用的平台,而且是蛋白
质活化作用的调控构件。通过分析,一些
R
基因产
物的氨基酸序列具有高度保守的区域。根据这些保
守区域设计引物来扩增基因组
DNA
cDNA
可获
RGA
,这为分离抗病基因或抗病相关序列提供了
一种新方法。
NBS-LRR
类基因的研究还可与分子
标记技术相联系,通过一些分子标记,可将一些
RGAs
定位在相应的遗传图谱上,从而逐步接近抗
病基因,这不仅有助于对抗病机制的分析与认识,
而且也能加速挖掘抗病基因的进程。我们对近年来
国内外有关
NBS-LRR
类基因的介绍做了一个较系
统的总结,以期为更好的利用
NBS-LRR
类基因来
克隆和分离抗病基因奠定基础。
1 R
基因
Flor
1971
年提出了著名的基因对基因假说
(Flor, 1971)
,他认为基因对基因相互作用的显著标
志是过敏性反应
(hypersensitive reaction, HR)
的诱
导,
HR
是植物抵抗病原菌的一种机制与植物抗病
性有直接关系。该假说成为了目前克隆植物抗病基
因的理论基础。
植物的抗病性是植物为了抵抗病原物的侵染、
扩展和危害而在形态结构和生理生化等方面在时间
和空间上的综合表现,其实质是抗病性基因表达的
结果,通过抗病基因的表达和相关基因的调控而实
现的。植物抗病性的强弱决定了抗病基因的表达强
度和速度
(
徐炎
, 2000,
西北农林科技大学
, pp.15-16)
植物的防御反应可以分为植物基本防御与
R
基因调
节防御两种类型,绝大多数
R
基因含有
NBS-LRR
区域,它是植物免疫系统的重要组份
(Shang et al.,
2009)
R
基因在植物的病害防御过程中起着非常重
要的作用,一旦病原菌侵入植物表皮将遇到
R
基因
avr
基因的互作,即植物的非寄主抗病性
(
孙文丽
, 2008)
2 RGA
R
基因
抗病基因同源序列
(resistance gene analog, RGA)
是一种存在于植物基因组中具有某些特定保守结
构域的
DNA
区段。抗病基因克隆对于培育抗病作
物新品种和研究病原物与寄主作物之间互作的分
子机制具有重要的意义。根据植物抗病基因保守序
列结构特点设计引物来扩增基因组
DNA
cDNA
可获得抗病基因同源序列,为筛选抗病基因或抗病
相关基因提供了一种有效手段
(
贺超英等
, 2001,
www.scichina.com)
RGA
R
基因之间的关系主要有三种
(
王华峰
,
2004)
。第一,
RGA
R
基因或假基因的一部分。
第二,
RGA
R
基因紧密连锁。第三,
RGA
与目
的抗病基因无关。连锁分析表明很多
RGA
R
因紧密连锁,甚至就是
R
基因的一部分,这为进一
步筛选克隆目的
R
基因奠定了重要的基础。因
RGA
结构域不同可分为
4
类,第一类是
NBS-LRR
类抗
病基因。这类基因的特点是在它们编码蛋白的近
N
端存在着
NBS
,而在它们的近
C
端则由
LRR
组成。
这一类蛋白一般存在于细胞质中,如烟草抗花叶病
毒基因
N
基因。第二类是
LRR-TM
类抗病基因,它
们的
N
端存在一个胞外
LRR
,而在
C
端具有由疏
水氨基酸组成的跨膜区
(TM)
,如番茄抗叶霉病不同
生理小种的基因
cf
-
2
cf
-
4
以及甜菜抗包囊线虫的
基因
Hs1
。第三类是
LRR-TM-STK
类抗病基因,它
含有与
cf
-
9
蛋白相似的胞外
LRR
受体结构域,又
含有与
Pto
蛋白相似的胞内
STK
结构域,在这两个
区域之间存在一个跨膜区
(TM)
,如水稻抗白叶枯病
基因
Xa21
。第四类是
STK
类抗病基因,它没有
LRR
结构域,如番茄
Pto
Fen
Lr10
基因。在这四类中
NBS
类抗病基因为主,
NBS
即核苷酸结合位点
(Nucleotide binding site)
LRR
为富含亮氨酸重复
(Leucine-rich repeats)
Meyers
(1999)
的研究结果
表明:双子叶植物中同时存在
TIR-NBS-LRR
non
TIR-NBS-LRR
两类抗病基因,并且
non TIR-NBS-
LRR
类抗病基因中的
Kinase
-
2
的共有序列可总结
(Y/V)(L/V)(L/I/V)V(L/V)DD(I/V)W
,最后一个氨
基酸为天冬氨酸
(D)
,而在
TIR-NBS-LRR
Kinase
-
2
的共有序列可总结为
(V/L/I)(L/I/V)(L/I/V)V(L/I/V)
DD(V/I)X
,最后一个氨基酸为任意氨基酸,通常为
色氨酸
(W)
。因此在
Kinase
-
2
末端中,当最后一个
氨基酸为色氨酸
(W)
时,该基因属于
non-TIR-NBS-